Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA1P15976 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA1P15976 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA1P15976 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA1P15976 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATA1P15976 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATA1P15976 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms