Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms