Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA4P13612 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms