Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP2P13473 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP2P13473 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms