Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMC1P11047 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMC1P11047 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMC1P11047 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms