Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF1P10914 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF1P10914 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF1P10914 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF1P10914 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF1P10914 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms