Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HKR1P10072 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HKR1P10072 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms