Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2BP0DI82 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC2BP0DI82 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms