Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC166P0CW27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC166P0CW27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms