Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms