Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRCP08575 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms