Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TPM2P07951 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPM2P07951 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM2P07951 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM2P07951 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPM2P07951 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPM2P07951 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPM2P07951 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms