Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYBBP04839 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYBBP04839 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYBBP04839 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYBBP04839 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYBBP04839 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYBBP04839 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYBBP04839 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms