Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOD2P04179 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOD2P04179 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOD2P04179 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOD2P04179 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOD2P04179 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOD2P04179 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOD2P04179 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOD2P04179 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOD2P04179 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms