Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX18O95935 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX18O95935 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX18O95935 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX18O95935 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX18O95935 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX18O95935 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBX18O95935 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBX18O95935 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX18O95935 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms