Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYF2O95926 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYF2O95926 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYF2O95926 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYF2O95926 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYF2O95926 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYF2O95926 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYF2O95926 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYF2O95926 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYF2O95926 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYF2O95926 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYF2O95926 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms