Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX58O95786 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX58O95786 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX58O95786 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX58O95786 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX58O95786 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms