Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB6O95452 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB6O95452 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB6O95452 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB6O95452 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB6O95452 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB6O95452 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB6O95452 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms