Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSTN1O94985 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms