Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCATO75600 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCATO75600 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCATO75600 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCATO75600 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCATO75600 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GCATO75600 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCATO75600 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCATO75600 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCATO75600 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCATO75600 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCATO75600 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCATO75600 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCATO75600 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCATO75600 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCATO75600 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCATO75600 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCATO75600 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms