Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP2O75563 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKAP2O75563 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms