Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F6O75461 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F6O75461 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F6O75461 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F6O75461 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F6O75461 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F6O75461 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F6O75461 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F6O75461 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F6O75461 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F6O75461 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F6O75461 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms