Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF253O75346 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF253O75346 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms