Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA4O75335 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA4O75335 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA4O75335 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms