Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP2O75323 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP2O75323 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms