Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIA3O75145 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA3O75145 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms