Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTSVO60911 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CTSVO60911 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTSVO60911 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTSVO60911 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTSVO60911 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTSVO60911 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTSVO60911 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTSVO60911 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms