Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUPR1O60356 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms