Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2AO43633 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2AO43633 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms