Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCXO43602 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCXO43602 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCXO43602 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCXO43602 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCXO43602 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCXO43602 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCXO43602 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCXO43602 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCXO43602 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCXO43602 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms