Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DENRO43583 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DENRO43583 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DENRO43583 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DENRO43583 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DENRO43583 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DENRO43583 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DENRO43583 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DENRO43583 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms