Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNQ3O43525 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNQ3O43525 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNQ3O43525 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNQ3O43525 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ3O43525 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNQ3O43525 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms