Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERI3O43414 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERI3O43414 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERI3O43414 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERI3O43414 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERI3O43414 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERI3O43414 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERI3O43414 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERI3O43414 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERI3O43414 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERI3O43414 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERI3O43414 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms