Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRXO43186 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRXO43186 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRXO43186 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRXO43186 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRXO43186 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRXO43186 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRXO43186 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms