Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLOCKO15516 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms