Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBDO15205 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBDO15205 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBDO15205 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBDO15205 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBDO15205 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms