Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD28O15084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms