Protein–RNA interactions for Protein: O00590

ACKR2, Atypical chemokine receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR2O00590 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR2O00590 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR2O00590 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms