Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBAG9O00559 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBAG9O00559 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBAG9O00559 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBAG9O00559 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EBAG9O00559 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EBAG9O00559 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBAG9O00559 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBAG9O00559 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms