Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHL1O00533 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHL1O00533 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHL1O00533 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHL1O00533 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHL1O00533 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHL1O00533 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHL1O00533 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms