Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGRNO00468 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGRNO00468 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRNO00468 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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