Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIEO00221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIEO00221 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms