Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAPO00193 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAPO00193 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAPO00193 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAPO00193 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAPO00193 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAPO00193 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAPO00193 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAPO00193 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAPO00193 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms