Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms