Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP17L12C9JPN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L12C9JPN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms