Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf172C9J069 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf172C9J069 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms