Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BECN2A8MW95 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN2A8MW95 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms