Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MVJ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MVJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MVJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MVJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms