Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L5A8MUK1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L5A8MUK1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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