Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PP2D1A8MPX8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PP2D1A8MPX8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms